Computational Chemistry zum Praktikum Physikalische Chemie

In diesem Kurs, der Teil des Praktikums Physikalische Chemie ist, lernen Sie, Rechnungen mit Elektronen-Korrelation durchzuführen. Anbei finden Sie Unterlagen, die im Kurs gebraucht und besprochen werden:

Korrelierte Ab Initio Rechnungen

Informationen zum Kurs
Organisatorisches zum Computer-Versuch
Organisatorisches zum Computerteil IR und Flash
Unterlagen zur Vorlesung
Einführung in korrelierte Methoden basierend auf Notizen von Prof. W. Klopper
Lernziele

Molekulardynamik Simulation eines Single Molecule Pulling Experimentes

Sie werden auch einen Versuch durchführen, bei dem Sie Simulationstechniken anwenden und eine Molekulardynamik Simulation analysieren. Dazu sind als allgemeine Einführung in die Thematik die folgenden beiden Artikel zu lesen:

Kurzer Artikel zur Geschichte von Kraftfeldern und Simulationen (M. Levitt)
Kurzer Artikel zu Biomolekularen Simulationstechniken (M. Karplus)

Spezifische Informationen zu Pulling Experimenten und Simulationen finden Sie in den Arbeiten von Gaub, Schulten, und Dellago.

Die Versuchsanleitung ist hier zu finden: Steered MD von (Ala)10

Die notwendigen Input Files und Scripts sind hier.

Sie werden von Akshaya K. Das betreut.

Spezielles: Am Montag der Woche, in welcher Sie den Versuch durchfuehren, findet eine kurze Vorbesprechung mit dem Assistenten statt.

Abgabetermin fuer das Protokoll (pdf an akshaya.das@unibas.ch mit cc: an m.meuwly@unibas.ch): 10 Tage nach Versuchsbeginn.

Besprechung: nach Vereinbarung.