In diesem Kurs, der Teil des Praktikums Physikalische Chemie ist, lernen Sie, Rechnungen mit Elektronen-Korrelation durchzuführen. Anbei finden Sie Unterlagen, die im Kurs gebraucht und besprochen werden:
Korrelierte Ab Initio Rechnungen
Unterlagen und Informationen zum Kurs
Einführung in korrelierte Methoden basierend auf Notizen von Prof. W. Klopper
Lernziele
Molekulardynamik Simulation eines Single Molecule Pulling Experimentes
Sie werden auch einen Versuch durchführen, bei dem Sie Simulationstechniken anwenden und eine Molekulardynamik Simulation analysieren. Dazu sind als allgemeine Einführung in die Thematik die folgenden beiden Artikel zu lesen:
Kurzer Artikel zur Geschichte von Kraftfeldern und Simulationen (M. Levitt)
Kurzer Artikel zu Biomolekularen Simulationstechniken (M. Karplus)
Spezifische Informationen zu Pulling Experimenten und Simulationen finden Sie in den Arbeiten von Gaub, Schulten, und Dellago.
Die Versuchsanleitung ist hier zu finden: Steered MD von (Ala)10
Die notwendigen Input Files und Scripts sind hier.
Bitte beachten Sie, dass dieser Versuch in den Räumen der Gruppe von Prof. Meuwly durchgeführt wird. Sie werden im Büro 6.07 arbeiten und von Dr. Yang betreut.
Spezielles: Kommen Sie um 14:00 am Tag, an dem Sie den Versuch durchführen, bei Prof. Meuwly zu einer kurzen Vorbesprechung vorbei.
Abgabetermin fuer das Protokoll (pdf an m.meuwly@unibas.ch): 10 Tage nach Versuchsbeginn.
Besprechung: nach Vereinbarung.